โรงเรียนวัดวาปีรัตนารามวิทยา พระปริยัติธรรม แผนกสามัญศึกษา ตั้งอยู่ภายในบริเวณวัดวาปีรัตนาราม เลขที่ ๑๔๑ หมู่ ๒ ตำบลหนองโพ อำเภอตาคลี จังหวัดนครสวรรค์ มีเนื้อที่ ประมาณ ๔๒ ไร่ ๓ งาน อยู่ในเขตพื้นที่บริการของ  บ้านหนองโพ บ้านหนองเต็งรัง บ้านห้วยดุก ในปีพ.ศ. ๒๕๓๖ พระครูนิพัทธปริยัติกิจ(หลวงพ่อบุญมี)เจ้าอาวาสวัดวาปีรัตนาราม ได้ทำเรื่องเสนอกรมศาสนา กระทรวงศึกษาธิการ ขอเปิดโรงเรียนพระปริยัติธรรม แผนกสามัญศึกษา ในระดับมัธยมศึกษาตอนต้น คือชั้นมัธยมศึกษาปีที่ ๑ – ๓ เมื่อได้รับอนุญาตจึงได้เปิดทำการเรียนการสอนในปีการศึกษา ๒๕๓๖ เป็นต้นมา  ต่อมาในปี พ.ศ. ๒๕๓๙ พระครูนิพัทธปริยัติกิจ(หลวงพ่อบุญมี) ผู้จัดการโรงเรียนวัดวาปีรัตนารามวิทยา จึงทำเรื่องเสนอขอเปิดทำการเรียนการสอน ในระดับมัธยมศึกษาตอนปลาย คือชั้นมัธยมศึกษาปีที่ ๔ - ๖  เพื่อเป็นการสงเคราะห์แก่ผู้ด้อยโอกาสทางการศึกษา ให้มีโอกาสศึกษาต่อในระดับที่สูงขึ้นต่อไป  

โรงเรียนวัดวาปีรัตนารามวิทยา  พระปริยัติธรรม แผนกสามัญศึกษา  เป็นโรงเรียนมัธยมศึกษา สังกัดสำนักงานพระพุทธศาสนาแห่งชาติ  มีประวัติการดำรงค์ตำแหน่งของผู้อำนวยการโรงเรียนตามลำดับดังนี้

พ.ศ.๒๕๓๙  พระมหาสวิท สุวฑฺโน วุฒิการศึกษา นักธรรมชั้นเอก เปรียญธรรม ๕ ประโยค, ศึกษาศาสตรบัณฑิต แขนงวิชามัธยมศึกษา วิชาเอกภาษาไทย ดำรงตำแหน่ง ครูใหญ่

          พ.ศ.๒๕๔๐  พระครูศรีรานันท์ (พระมหาหรรษา ธีรานนฺโท) ดำรงตำแหน่งอาจารย์ใหญ่โรงเรียนวัดวาปีรัตนารามวิทยา  เมื่อวันที่   ๑๖  พฤษภาคม  พ.ศ. ๒๕๔๐

          พ.ศ.๒๕๕๒-๒๕๖๐  พระมหาบุญศรี ชุติปญฺญโญ   รับตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดวาปีรัตนารามวิทยา  เมื่อวันที่ ๒๑ ตุลาคม  พ.ศ. ๒๕๕๒  

          พ.ศ.๒๕๖๐-๒๕๖๒ พระมหาฐิติชโยกรณ์  วชิรเมโธ รับตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนวัดวาปีรัตนารามวิทยา  เมื่อวันที่    พ.ศ. ๒๕๖๐  

          พ.ศ.๒๕๖๒-๒๕๖๔ พระจักร   จนฺทสาโร รับตำแหน่งเป็นรักษาการผู้อำนวยการ

          พ.ศ.2564  ปัจจุบัน พระเฉลิม   ฉนฺทโก รับตำแหน่งเป็นผู้อำนวยการโรงเรียนวัดวาปีรัตนารามวิทยา เมื่อวันที่ 3 มีนาคม พ.ศ.๒๕๖๔